於是他手下就有了兩支三級輔助艦隊，一支二級輔助艦隊，經過了一個半月四十多天的運作，他終於把自己的艦隊全部建立起來了。
四十多天內，他一直考察整個水道，港口，艦隊，編製艦隊人員，接見各種軍官和士兵，同時想著怎麽穩固防守波多黎各，同時派遣剛剛兩艘的偵察艦隊去偵察周圍，對周圍的情況有所了解，同時不斷接受情報，來自巴拿馬的電報，對於本土或者其他艦隊的情報，他是接不到的，他屬於中下層軍官。
他隻能來自上級的一級輔助艦隊的指導，來自主力艦隊新建立的輔助艦隊，三支一級輔助艦隊，一支在科隆港對岸，一支在科隆港，一支在委內瑞拉的馬卡波灣，主力艦隊駐紮在科隆港扣，另外運河通航以後，主力艦隊有一部分在大巴拿馬城，大巴拿馬城也有一支艦隊，不過是先前組建的二級輔助艦隊，和他艦隊性質一樣。
屬於駐紮在科隆港口的一級輔助艦隊的下屬的一支二級輔助艦隊。
四名中尉，九名少尉，三名軍士長，二十名軍士，這是他暫時的軍官搭配，自從艦隊建成以後，一個星期以後，他就帶著艦隊出海進行磨合訓練，輪流駐守兩個島嶼上進行後勤補給，駐守訓練。
張思遠很有收破爛的想法，在又修好幾艘商船以後，他派包子去打撈那些被打沉的戰艦，一艘一艘的拖回去，然後大塊大塊的拆解，給那些島上的俘虜找點事情做，三萬多的俘虜，清理兩座被炸壞的島嶼港口，修築防禦工事，修理道路，這些事情，用了大約一個月時間都完成了，除了那些重傷的俘虜有的死掉兩千人以外，其他的俘虜基本上痊愈了。
這就給他們找點事情做，不能讓他們閑著，於是出海打撈沉船，回來拆解，就是成了俘虜們的工作，加上原先港口裏麵的沉船，清理水道，俘虜們忙的不可開交，雖然鍛煉了他們的身體，可也讓他們沒有時間思考，思考那些逃跑或者對抗的事情。
不過三萬多俘虜對於兩座彈丸大小的小島還是太大了，在請示了上級的一級輔助艦隊的上尉以後，他命令包子率領他自己的三級輔助艦隊，加上兩艘驅逐艦，以及這邊的商船，運送了一萬八千多俘虜去南美，交給羅左負責看守和使用那些俘虜。
包子走了以後，偵察艦隊負責起聖胡安的駐守工作，然後主力艦隊的一艘驅逐艦被派去駐守，艦長擔任指揮官，壓陣聖胡安。
至此，張思遠自身的艦隊實力已經基本上定型了，並且恢複了原先駐守這裏的上尉帶領的艦隊的八成實力，張思遠對於接下來的駐守十分有信心，但他並不是擔心自己的駐守任務不能平安完成，他想著的是，如何才能建立更高的功業，因為現在新秦國同英國人的戰鬥形勢依然不是和明朗。
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