生化標記：以基因表達的蛋白質產物為主的一類遺傳標記係統
主要包括貯藏蛋白（非酶蛋白）、同工酶（酶蛋白）等標記
同工酶特點：具有功能相同但結構及組成有差異、遺傳學行為符合孟德爾規律、共顯性表達、具有多型性等特點
同工酶應用的優點：可以通過直接采集組織、器官等少量樣品進行分析；蛋白質是基因表達的產物，並可以直接反映基因產物的差異；在豆類作物中已經發展了近70種酶檢測係統，可以鑒定大約100個左右的基因座位。在水稻等作物中，已鑒定出具有多態性的同工酶位點近160個
同工酶應用的缺陷：可使用的同工酶標記的數目有限，大多數作物不足
30個；表現出多態性的同工酶種類和等位基因少；每一種同工酶標記都需要特殊的顯色方法和技術；某些酶的活性具有發育和組織特異性；同工酶標記局限於反映基因組編碼區的表達信息
DNA分子標記：是DNA水平上的遺傳多態性
應用：種質資源研究、係統分析、品種注冊及專利保護、遺傳圖譜構建、基因定位、分子標記輔助選擇
優點：直接以DNA的形式表現，在植物體的各個組織、各發育時期均可檢測到，而且不受環境限製，不存在是否表達的問題；數量多，遍及整個基因組，檢測位點近乎無限；多態性高，自然界存在許多等位變異，不需要專門創造特殊的遺傳材料；表現為“中性”，即不影響目標性狀的表達，與不良性狀無必然的連鎖；許多分子標記表現為共顯性，能夠鑒別出純合基因型與雜合基因型，提供完整的遺傳信息。
DNA分子標記可分為哪幾類？
（1）基於DNA-DNA（分子）雜交的分子標記
（2）基於PCR技術的分子標記
（3）基於PCR和限製性酶切相結合的分子標記
（4）基於DNA芯片雜交技術的分子標記
（5）針對特定結構域的分子標記
（6）高通量分子標記
3、試述限製性長度多態性（RFLP）標記產生的原理、特點和發展RFLP標記的基本步驟。
原理：（1）利用特定的限製性內切核酸酶消化不同生物個體的基因組DNA，所產生的DNA數目和各個片段的長度反映了DNA分子上不同酶切位點的分布情況
（2）瓊脂糖凝膠電泳將這些片段按大順序分離開來，然後將它們按原來的順序和位置轉移至易於操作的尼龍膜和硝酸纖維膜。
（3）用放射性核素（如32P）或非放射性物質（如生物素、地高辛等）標記的DNA作為探針，與膜上的DNA進行雜交
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