萬曆三十五年（1607年），舒爾哈齊的地位一落千丈，變成了一個有名無實的人物，他痛感自己與努爾哈赤勢難並存。
於是，他與長子阿爾通阿，三子紮薩克圖商議，圖謀另立門戶，與兄長分庭抗禮。舒爾哈齊帶著幾個兒子和少數部下來到了鐵嶺東南的黑扯木，在那裏伐木建造房屋，開辟新的根據地。而黑扯木臨近明朝的軍事重鎮鐵嶺，可以直接依靠明朝的軍事保護，在他的東麵又與烏拉部落接鄰，能隨時得到盟友的援助。
舒爾哈齊開始與努爾哈赤越來越疏遠，轉而靠近明朝了。李成梁看到這一分化女真的大好機會，於是火上澆油，故意挑起矛盾衝突。他上奏朝廷冊封舒爾哈齊為建州右衛首領，這是明朝在遼東地區設立的最高地方軍事長官。
努爾哈赤首先是責令舒爾哈齊放棄自立為王的念頭，在勸說無效的情況下，努爾哈赤斷然采取了強硬措施，於萬曆三十七年（1609年）三月，舒爾哈齊的兩個兒子阿爾通阿、紮薩克圖被努爾哈赤誅殺，部將武爾坤也被處死。
努爾哈赤餘怒未消，仍打算將他的次子阿敏處死，隻是在皇太極等人的極力求情下，阿敏才逃過一劫，免於一死，不過他的一半家產被沒收。
麵對兄長咄咄逼人的姿態，舒爾哈齊失去了繼續抗爭的勇氣。他知道自己的實力遠遠不如兄長，而且他所指望的靠山，駐紮在遼東的明軍，也處在岌岌可危的境地，根本不是努爾哈赤的對手。在萬念俱灰的絕望處境下，舒爾哈齊回到了兄長的帳下。但是這次的努爾哈赤對他不再講兄弟情誼了，舒爾哈齊被囚禁在一間暗室之中，用鐵鎖鎖住，僅有兩個孔穴給他送食物。
萬曆三十九年（1611年）八月十九日，舒爾哈齊在囚禁中死去，時年四十八歲。有一說他是被兄長努爾哈赤秘密殺害的。
正因為皇太極曾經救過阿敏的性命，阿敏這個時候才會冒著觸怒大汗的風險為皇太極說話，將大汗認為的失敗，糾正為隻是打平手！
努爾哈赤看了看眾人，並沒有說阿敏對，也沒有說阿敏錯：“你們也都說說話！大家一起看看接下來要怎麽辦！？是趁著天地會在遼南立足未穩，接著打他們！還是等一等，等到開春，我們的糧食壓力稍微緩和一些，再打天地會？不過，再等一陣的話，遼南在遼陽城到險山堡的漫長長城修築，再過兩個月想攻打天地會，可能更加困難！”
“父汗，我大金國近來連番與蒙古人，遼東明軍，毛文龍軍作戰，部族飽受賦稅繁重之苦，無法支持多麵應敵。我認為我們應該先穩固建設本地，占據一片土地，治理一片土地，並不該急於攻城略地。要戰，則得保證必勝！像這段時間遼南的對拚，是漢人希望的，喜歡看到的局麵，而不是我們八旗精銳所希望遇到的戰局！我們不應在冬季，在城防攻堅戰中與漢人對拚！隻有用少量的兵力，讓漢人自己打自己人，我們才能應付人口眾多的漢人。”說話的是阿巴泰。
阿巴泰的母親伊爾根覺羅氏，萬曆十四年（1586年）與努爾哈赤成親，是他的第七房妻子。伊爾根覺羅氏出身一般，生前沒有受過努爾哈赤的寵幸，死後也沒獲過任何哀榮。她連生卒年月都沒有留下，在清朝史書中甚至沒有隻言片語的記載。
阿巴泰母親地位較低，直接影響到他日後在諸兄弟中的排位。不過，因為在年齡上的優勢，阿巴泰比諸弟較早參與征戰，較早建功立業，所以努爾哈赤對他還是比較器重的。
萬曆三十九年（1611年），年僅23歲的阿巴泰第一次奉父命率軍遠征。當時，北方寧古塔地方（今黑龍江省寧安縣一帶）的首領僧格、尼喀禮到努爾哈赤居住的赫圖阿拉城進貢，努爾哈赤贈給他們鎧甲40副。從赫圖阿拉至寧古塔，路途遙遠，僧格、尼喀禮攜鎧甲行至綏芬路（今黑龍江綏芬河流域），被烏爾固宸（在今俄羅斯境內比金河一帶）和穆棱（今黑龍江省穆棱河流域）二地的部落搶走。努爾哈赤幾次派人追索未成，便派遣阿巴泰和大將費英東、安費揚古率兵一千攻取烏爾固宸和穆棱二地。這是阿巴泰參加的第一次遠征。這次遠征，對青年阿巴泰來說，無疑是一次難得的曆練。從此，開始了他30餘年的戎馬生涯。
天命三年（1618年），努爾哈赤以“七大恨”誓師征伐明朝，阿巴泰隨征。攻克撫順城時收降明遊擊參將李永芳。李永芳官職雖低，卻是第一個公開投降後金的明將。努爾哈赤極力籠絡，授予他三等副將，統轄撫順降民，並將阿巴泰的女兒嫁給他。此後，李永芳對內對外稱“撫西（即撫順）額駙”，竭盡忠誠報效後金。李永芳的9個兒子，後來都做了清朝的高官。
不管是因為出身低微，還是因為與漢人的關係，因為李永芳的關係，阿巴泰都要顯得與其他滿人貴族有所不同。
大家都主張強硬，阿巴泰主張穩妥發展，則更能吸引父汗努爾哈赤的注意。
不過，阿巴泰的話卻引來皇太極的暗中憎恨！
皇太極覺得阿巴泰是在說他敗了，而且敗得很慘！最關鍵是指責他沒有穩固住遼南已經獲得的大片土地。
在原本的曆史中，皇太極也與阿巴泰關係不好。天命十一年（1626年）九月，皇太極繼位之初，封賞諸貝勒並賜宴。赴宴的諸貝勒中，地位最顯赫是代善、莽古爾泰、阿敏、阿濟格、多爾袞、多鐸、嶽讬。阿巴泰雖已38歲，因隻是個貝勒，座位排在了諸和碩貝勒以下。眼瞅著諸弟侄觥籌交錯、開懷暢飲，他深感臉上無光，心中鬱悶不樂。回到府第，不禁對屬下大發牢騷：“今後我再不赴宴！”“戰則我披甲胄而行，獵則我佩弓矢而往，赴宴而坐於子弟之列，我覺可恥。” 本章尚未完結,請點擊下一頁繼續閱讀---->>>