林丹汗一直與後金人是敵對關係的，林丹汗是正宗的黃金家族後裔，大元朝的玉璽還在林丹汗那。
奈何蒙古人內鬥世界第一，沒有人服林丹汗。
漠南蒙古由於離清朝最近，所以跟清朝最早開戰的就是漠南蒙古。
當時漠南蒙古大致分了七八個部落聯盟，各自為政。
漠南蒙古當時的汗王是林丹汗，正根的成吉思汗後裔。
林丹汗的成吉思汗後裔身份根本沒有用，林丹汗控製的部族太少，人口也比內喀爾喀和科爾沁草原多不了多少。
遠在新疆的漠西蒙古部落與林丹汗公開分裂；就連同處於內蒙古的科爾沁、內喀爾喀、土默特、鄂爾多斯等蒙古諸部也都不服他。
所以林丹汗雖然名義上是蒙古大汗，但他的地盤僅僅隻有隻能察哈爾蒙古這一部而已。
這種局麵對於林丹汗來說當然不能忍了，於是林丹汗發動了統一蒙古的戰爭。
結果林丹汗忙乎了大半天，一個部落都沒有被他降服，而像科爾沁等部，反倒還跑到了努爾哈赤一邊，與滿洲人結成了生死同盟，一起揍林丹汗。
截止到曆史上的努爾哈赤死前，漠南蒙古基本都跟滿清眉目傳情，就差擁戴努爾哈赤當蒙古大汗了。
在原本的曆史中，努爾哈赤死後，皇太極繼位。
崇禎元年，皇太極一征察哈爾，在清軍西征前，林丹汗就已經率部退到了內蒙古的河套，隻留了一小部分人在察哈爾。
這點人怎麽可能抵得住清軍，於是當年九月，滿洲八旗正式吞並了蒙古察哈爾部。
林丹汗失去了根據地，勢力大大受挫。
被清軍揍了，林丹汗就想在明朝身上把損失的再找回來。
於是他大舉入侵大同，殺死明朝軍民數萬人，差點攻占大同城，結果惹到了年輕氣盛的崇禎皇帝，為後來明朝對他見死不救埋下伏筆。
皇太極是真正的梟雄，皇太極的名字本來在滿族人裏是個普通的名字。
但名字跟他本人的英雄豪氣完全不配。
崇禎五年，皇太極二征林丹汗。
臨行前，皇太極傳令歸順後金的蒙古各部速率部來會。
於是科爾沁、紮魯特、土默特、阿魯科爾沁等十幾個漠南蒙古諸部紛紛齊集於西拉木倫河岸，總兵力約十萬，與滿洲八旗一同會剿林丹汗。
當時林丹汗駐帳於宣府邊外，聽說皇太極帶十幾萬人來找自己玩命後，非常震驚，於是率眾西奔。
皇太極則分兵三路窮追猛打，一直追殺了四十一天，從河北一直殺到了寧夏，硬是把林丹汗給攆到了青海。
兩年後，林丹汗在青海病死。
他的兒子額哲率餘部從青海返回河套地區，漠北外喀爾喀的車臣汗碩壘致函額哲，讓他移帳漠北。
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