追究當初丘橓抄沒張家的奏章絡繹不絕，與李植等禦史形成罵戰。
申時行府上一時間車馬不絕，官員們都上門求申時行出麵，在子麵前保下河南官員。
就在這時，林延潮的奏章抵京師。
林延潮奏章彈劾原歸德府知府，同知主謀了禦史被刺之案，河道衙門監督不利至河工敷衍，除此二處外，於河南道其他官員一字不提，等同於保下了這些官員。
林延潮奏章一上，本是磨磨蹭蹭一個月多的三法司會審官員立即精神抖擻，馬上有了結論。歸德府知府，同知為首犯，但河道衙門，及其餘官員雖有失職之處，卻並非大罪。
於是子召三輔臣議事，最後商議此案。
當時議論經過外人不得而知，隻是後世申時行所撰的文章中窺得一絲半點。
子召三輔臣至乾清宮暖閣問道：“河南大災，民不得安生，其罪乃關於吏弊，或是朕德不修？”
申時行對道，臣等竊見近年以來，並非河南一地，各處奏報災傷，如陝西亢旱、江南大水、江北又有蝗蟲。但河南黃河衝決，委的災傷重大。皇上聖德方隆，豈宜有此？這是臣等奉職無狀所致。臣等自當痛加修省外，整治吏弊。”
子容色稍寬曰：“丘橓參劾河道官員貪墨，不恤百姓。這些官員當如何處置？”
申時行對道：有司為民父母，若是貪贓壞法，百姓不得安生，自當問責有司。臣有等一得之愚，眼下河南百姓於水深火熱之中，嚴懲貪官汙吏並非治本之道，若要救百姓，平息民怒在於蠲免賑濟。”
子道：“太後憨山大師有言，朕即位以來，雖是下太平，但對官員懲罰不免太重，昔日張江陵之案，因言官彈劾不休，牽涉太多官員，官員們人心惶惶，以至朝綱動搖，故而下才有這麽多災害。朕反思再三，打算恩撫下。”
申時行道：“聖見高明，深切時弊。臣等不勝仰服。容臣等撰擬手敕，上請聖裁施行。”
子道：“可。”
於是申時行退下後擬旨，子禦覽後昭告下。
謀害禦史呂毓昌的三位奴仆，偽造假證的仵作等一律秋後問斬。
指使殺人的原歸德府同知，勒令自盡。
包庇縱容的歸德府知府籍沒家財，刺配流放遼東，遇赦不赦。
右布政使董汝漢調廣東右布政使。
河道總督李子華等其餘官員盡數罰俸。
被殺禦史呂毓昌追贈參政銜，以三品官之禮下葬，朝廷於其家鄉表彰其忠節。
丘橓破案有功，增俸一秩，林延潮稟案情有功，賜銀百兩。
最後子重申，不許言官再拿張居正案事，禦史李植，江東之，羊立可等盡罰俸一年。
但官員得得失失，並非如此簡單，這一次申時行與言道的交鋒，最後言道敗北，申時行大獲全勝。申時行保住了相位，贏得子信任，並博得寬大之名。
而丘橓雖被子嘉獎，但遭眾官員彈劾下，清名盡毀，向子請求辭官。
子準予致仕。
本章已閱讀完畢(請點擊下一章繼續閱讀!)