接替首輔的是張四維，他任職時間不長，此後長期主政的是申時行。申時行是一位典型的學者型官僚，嘉靖四十一年(1562)廷試，因所對策論，詞劄兼美，被嘉靖擢為頭名狀元，授予翰林院修撰。萬曆初年，申時行就為萬曆所信用，雖不是開啟日講時的最初六位蒙師之一，但半年後便來到了萬曆的身邊，是擔任功課最多的講官，很受萬曆的信賴和倚重。萬曆三年(1574)時，萬曆就曾手書“責難陳善”四個徑尺大字，賞賜給他。但申時行為人城府極深，處世圓滑，性格懦弱，害怕得罪皇帝，從不強諫，順從聖意。申時行總是順著皇帝的意思做事，皇上總是稱申時行為“先生”，不斷賞賜些小禮物，執政的後期賞賜更加頻繁，超過張居正，但他不敢就接受，屢次上本皇帝才沒有封賞。
萬曆空有一腔的雄心壯誌，朝廷事務事無巨細都必須按照他的意誌去做，又不能很好的實用人才，在後期有長期怠政，不能合理的擺布人才致使國家機器無法運轉，他又故意作亂，才導致來逐漸走向衰敗。他親政後急急忙忙幹的第二件大事就是為自己修建陵寢，曾四度親臨天壽山勘察，長達三十多年的修建，耗費巨資，使本來把本來富裕的財政拖向入不敷出的境地，這是他一生最不讓人稱道，最昏暈的舉動之一。
明十三陵，坐落在北京市郊昌平縣北十公裏的地方，這裏有一片連綿的青山，原名黃土山，是燕山的餘脈，屬太行山係。永樂皇帝把陵寢建在這裏，還將黃土山改稱天壽山，作為子孫世代營建陵寢的風水寶地。埋葬著明代的十三位皇帝。隆慶的突然死亡，讓朝廷的大臣們猝不及防，倉促之間，連一個像樣的陵寢都沒有來得及修好，還是張居正親自為隆慶皇帝選好的吉穴，這件事對萬曆的刺激很大。總是認為自己也會像父皇一樣突然死亡，就決定趁著自己青春年少，抓緊將陵寢修好。萬曆十一年(1583)正月二十三日，剛剛親政，萬曆給內閣下了一道諭旨，要於閏二月躬詣天壽山行春祭禮，勘選壽宮地基，起駕的時間就定在閏二月十二日。
萬曆駕臨天壽山，首先按照明朝的禮節，拜謁各位祖宗的陵寢，又按照禮部的安排依次勘查了祥子嶺、潭峪嶺、勒草窪三處，每到一處都會認真勘察，仔細聽取各方麵人員的匯報，態度非常的認真細致，不放過任何一個細節。但這一次考察，對這三處似乎均不滿意，無功而返，認為天壽山已沒有祥瑞之地，想到別處尋找，在眾大臣的勸說下，才勉強決定才讓大臣們在天壽山試一試。諭旨：要大臣們再相吉地二三處，畫圖貼說，進呈禦覽。這時，由於張四維回籍丁憂，申時行繼任首輔。申時行便和徐文壁會同禮、工部的徐學謨和楊兆一塊前往。回京後，徐文璧、申時行二人具名匯報了此行勘查的結果。
九月初六，萬曆為勘定壽宮吉地，二度前往天壽山。決定壽宮吉地就選在大峪山，讓申時行隨即傳諭禮部和欽天監知道。
吉穴已經選定，萬曆當然高興，一時興起，動用國庫的金銀大肆賞賜有功之臣，也處罰了一些辦事不力的大臣。
為了得到兩宮皇太後的同意，萬曆十二年九月十三日，他又攜同兩宮皇太後和眾後妃從京城出發，隨行人員無數，幾乎朝廷全班出發，還有眾多的警衛人員，聲勢浩大，規模空前。萬壽山之行結果還是不錯，兩宮太後為兒子苦心孤詣選定的風水寶地連連頷首稱善，壽宮吉地才算最後確定。
吉穴的選擇一波三折，又有人提出異議，於是，又第四次離京向天壽山進發。萬曆不辭辛苦，沿著黃山、寶山、大峪山東井平岡一線，再查看了一遍，認為寶山與大峪山同為吉地，礙於寶山介於二祖陵之間，不敢僭分，故依舊還定在大峪山。經過這一次折騰，萬曆已經看出民主集中製的必要性了，如果不趕快下定決心，就永遠不會定下了，到了該決斷的地方就必須決斷，千人做事一人當家，必要的獨裁還是要有的，他說；“今外廷諸臣為壽宮事爭言風水，夫在德不在險，從前秦始皇營驪山，何嚐不求選風水，結果不久就被掘開，選求何益?我祖宗山陵及卜於天壽山，聖子神孫，都當歸葬於此，哪來許多吉壤?我誌定矣。” 本章尚未完結,請點擊下一頁繼續閱讀---->>>