就吳三桂方麵說來，在南明政權尚未消滅之前，他與清政府命運相連，必須拚死作戰。他在鎮守雲南後實行了以下措施：在政治上，為了鞏固自己的地位，對於轄下的各級官吏，他“選用自擅”，“各省員缺，時亦承製除授，謂之西選”。當時清廷所給雲、貴二省督撫的敕書，都要寫入“聽王節製”四字。
與此同時，他還以重金收買在京朝官及各省將吏，為自己效勞。他還招納李自成、張獻忠餘部，編為忠勇五營、義勇五營，加緊訓練。此外，吳三桂還縱容部下將吏為非作歹，魚肉百姓，“殺人越貨，毫無畏忌，訟牒、命盜兩案，甲兵居其大半”。
登基稱帝
康熙十三年（1674年）十一月初五，吳三桂率兵經潭州至衡陽，以衡永郴桂道衡州知府衙門（舊衡陽市衡南區政府所在地）為“行殿”，指揮各路軍事。[20]
康熙十七年（1678年）三月初一日，吳三桂登基稱帝，改衡州府（今衡陽市）為“應天府”，改鍾鼓樓為“五鳳樓”，回雁門為“正陽門”，大街名“棋盤街”等，一切用京城名稱，冊妻張氏為皇後，孫吳世璠為皇太孫，加封文武，百官頒製新曆，鑄“昭武通寶”、“利用通寶”錢幣。稱帝時狂風大作，將臨時搭的帳篷都吹倒了。八月舉行雲、貴、川、湖鄉士，錄取者73人。[21][57]
經濟
在鎮守雲南時期，吳三桂在經濟上也有很大的勢力。他占據明代世鎮雲南的沐氏莊田700頃作為藩莊，又和西藏的達賴喇嘛在北勝州互市，以茶換取蒙古的馬匹。又派許多人出兵去做生意，販運遼東人參及四川的黃連、附子，以牟取利潤。他曾大量地貸錢給商人使用，謂之藩本。他強征關市之稅，開礦鼓鑄。
吳三桂欲效明代沐氏故事，世守雲南，所以從各方麵培植自己的勢力，以求達到這個目的。其他尚、耿二藩也和吳三桂一樣，其藩下兵各有15佐領，又綠旗兵各有六七千，並且也是經商括財，強征市稅，遍置私人，坐地稱霸。
軍事
助清入關
清軍到達山海關外十裏處後的當天下午，清、吳聯軍和李自成為數甚少的農民軍交戰於山海關外的一片石。次日，四月二十二日爆發了決定命運的石河大戰。根據清、吳雙方的約定，首先由吳三桂率領所部和李自成大軍作正麵交鋒。在戰鬥進行到最緊張的時刻，清軍突然從陣後繞出並向李軍發動了猛烈的進攻。李自成對清兵入關毫無所知，兼之以連日作戰，李軍士氣也處於再而衰的境地，雖然拚命搏戰，最終抵擋不住清、吳兩軍的凶猛攻擊，遭到嚴重的損失，“積屍相枕，彌滿大野’。農民軍被擊敗，李自成被迫率餘眾西走。山海關之戰以清吳聯合作戰的勝利和李自成農民軍的失敗而告結束。
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